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mirna,miRNA荧光定量PCR中的内参用什么?

时间:2024-06-12 09:21

miRNA荧光定量PCR中的内参用什么?

mirna的荧光定量pcr可以用actin做内参miRNA通过与转录本的相互作用,关闭或抑制基因的表达。最近的研究表明它们影响了约三成的基因。miRNA在多个组织中差异表达,这就让表达图谱分析成为研究的重点。同时,miRNA的过表达和抑制也是近年来常用的研究方法。我知道和使用过的U6内参基因只有两个:RNU6-1和RNU6-2.前一个就是常见的u6,后一个有时被称为u6b.在我的大鼠RNA样本当中,u6表达量有些太高,u6b的Cq值与我的目标miRNA比较接近,稳定性也很好.但是这些对植物样本中的内参基因选择没有什么指导意义.为了确定u6在植物中的保守性,比较快捷的办法是找到谈论这个话题的文献综述.如果没有人写过这样的综述的话,就只能靠自己去数据库找到所有序列自己对比了.关于内参基因的选择,必须实验确定特定样本中的表达水平稳定,其他文献中报导的内参基因不一定适合你的样本.做新的课题时,选择内参基因一般是选取3-5个常用的,PCR测试后选取.

mirna模板是什么?

mirna模板是一种在生物信息学领域中广泛使用的模板,用于描述microRNA的序列和结构特征。 根据实验测定和数据库记录,该模板提供了足够的信息来识别miRNA序列,并推断其生物学功能,如参与调节基因表达以及蛋白质翻译等。 此外,mirna模板对于研究肿瘤学、遗传学和表观遗传学等领域也具有指导和参考作用。

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怎样找到一个microRNA的靶基因?

这里有一个软件:miRTarBae,不错!它整合实验证实的miRNA靶标的数据库。输入感兴趣的miRNA,即可找到验证了的靶基因。靶基因在Wikipedia就可找到它的功能!目前自己的实验验证了10个miRNA,找到一个有意思的miR483,它在小鼠上靶基因是SOCS3(Suppressorofcytokinesignaling3)

pcr要灭菌吗?

要灭菌。PCR扩增对模板的要求不高 模板可以是纯化后的样品也可以是粗制品,不同来源的模板采取不同的处理方法,实验模板的纯化越简单越好,但模板中如果含有任何的Taq酶抑制剂、蛋白酶、核酸酶等,会干扰反应。模板提取注意保存,不能放置太久,避免反复冻融并防止降解。